很多自己有配方找工廠代加工合作的投資者，對于功能性食品和保健品什么區別并不是很清楚。其實，在國內對于功能食品并沒有嚴格、準確的定義，而是泛指具有特定營養保健功能的食品，也就是帶有小藍帽標志的健字號保健食品。而按照常規理解，人們將含有藥食同源物質的一些食字號產品也歸類到了保健品。
產品涵蓋類別范圍不同：功能性食品指保健食品;保健品包括部分食字號產品、特殊膳食和健字號產品。我們這里已經把保健品限定在口服食品范圍之內了，除此以外一些器械和外用產品，也會在保健品之列。
總體來講，功能性食品和保健品兩個名詞，是人們對大健康產品的習慣性稱謂，并不是嚴格意義上的產品類別分類。雖然指向不是特別準確，但是卻能言簡意賅的表明產品特點。
1，資質差異：食字號藥食同源類的壓片糖果、固體飲料、代用茶，或者運動營養特膳食品找工廠代加工合作，只需辦理營業執照便可，并且品牌資質也不是必須。但是對于健字號的保健食品而言，則需要自帶批號，并且要附帶產品品牌的相關資質。
2，產品差異：功能性食品，也就是保健食品在備案號下來以后，便有了特定的配方、工藝、包裝，這些數據都會體現在健字號批文中，并且產品實行一品一號，不可隨意改動。食字號產品則不同，配方、劑型、包裝都可在規定范圍內，靈活設計。
3，流程差異：食字號保健品代加工，加工廠與客戶之間通過樣品、價格及工期和起訂量便可確定合作關系;健字號功能性食品則需要工廠采用批號進行備案，通過現場核查驗收，取得相關生產批件以后，才能開展代工生產活動。
4，工廠差異：食字號的壓片糖果、固體飲料及代用茶產品，并不要求十萬級的GMP車間，而被歸為功能性食品的特膳膳食食品和保健食品則必須在十萬級凈化車間內。并且，從事保健食品代工生產廠家，需要具備產品批文中規定的完整生產工藝。
功能性食品和保健品的區別體現在對應產品類別上。前者對應健字號保健食品，而后者還涵蓋了食字號的壓片糖果、固體飲料和代用茶以及特殊膳食等。找工廠貼牌代加工相應產品需要區分對待，切不可一概而論。
